CIIL - Lettre d'information, Janvier 2026 - N° 18

[Translate to French:] Plateau Biofab & Mécanobiologie (BFM)

Croissance d'un domaine d’une bicouche lipidique supportée
Macro-ouverture trans-cellulaire par toxine bactérienne
Dureté de mitochondrie fluorescente mesurée par AFM
Manipulation de Y. Pseudotuberculosis pour observer les étapes précoces de l’infection cellulaire
Anneau d’actine vu en élasticité

Impression 3D et microfabrication

Le plateau dispose d’équipements d’impression 3D par stéréolithographie (SLA) et projection lumineuse (DLP) permettant la fabrication rapide et précise de dispositifs, moules et composants pour des applications en microfabrication et en ingénierie biomédicale.
Équipements : Formlabs 2, Formlabs 3, Formlabs 4, Formlabs 4B (biocompatible).

Un système de découpe et de gravure laser permet la fabrication et la personnalisation de pièces en polymères, bois ou acrylique, ainsi que la gravure de certains métaux et du verre.
Équipement : Laser Cutter Beambox Pro 50W (FLUX).

Un système simple de thermoformage est également accessible, permettant la reproduction rapide de moules plastiques.
Équipement : FormBox (Mayku).

Post-traitement
Des stations dédiées au lavage et à la polymérisation UV assurent le post-traitement contrôlé des pièces imprimées en 3D, garantissant leur qualité mécanique, dimensionnelle et leur compatibilité avec des applications biologiques.
Équipements : Form Wash (Gen 1 & 2), Form Cure (Gen 1 & 2), postes dédiés.

Conception numérique et simulation
La plateforme met à disposition des outils de conception assistée par ordinateur pour la modélisation 3D de dispositifs, ainsi que des outils de simulation multiphysique pour l’analyse des comportements mécaniques, fluidiques et physiques (déploiement en cours).
Équipements : Fusion 360 (Autodesk), COMSOL Multiphysics (prévue pour 2026).

Chimie et préparation de surface
Une hotte chimique équipée permet la préparation de surfaces, la silanisation et les traitements physico-chimiques nécessaires à la fabrication et à la fonctionnalisation de dispositifs microfabriqués.
Équipements : cloche sous vide, plaques chauffantes, équipements associés.

Station PDMS et microfluidique
Une station dédiée au PDMS permet le prototypage et la fabrication de puces microfluidiques, incluant le moulage, l’assemblage et la fabrication de membranes fines aux propriétés mécaniques contrôlées.
Équipements : paillasse PDMS, spin coater (Laurell), équipements associés.

Contrôleurs de flux microfluidiques
Des contrôleurs de flux microfluidiques permettent une gestion précise des débits et des conditions dynamiques dans les dispositifs microfluidiques, en particulier pour les applications en organes-sur-puce.
Équipements : FlowEZ (Fluigent).

Micropatterning et structuration de surfaces
Un système de micropatterning optique permet la structuration spatiale de surfaces, la polymérisation d’hydrogels et la création de microenvironnements cellulaires in vitro sur mesure.
Équipement : PRIMO (Alvéole).
Un dispositif UV-ozone est utilisé pour le nettoyage et l’activation de surface avant assemblage ou fonctionnalisation.
Équipement : UV-Ozone Cleaner Model 24 (Jelight).

Caractérisation mécanique et nanométrique
Plusieurs microscopes à force atomique (AFM), certains couplé à de la microscopie photonique, permettent l’étude à haute résolution des propriétés topographiques, mécaniques, et d’adhésion de matériaux et de systèmes biologiques : biomolécules, cellules, tissus. Le plateau dispose également de l’expertise et des ressources pour l’analyse des données.

Équipements :

  • Bruker-JPK NanoWizard V couplé à un microscope de super-résolution STED Abberior Instruments
  • Bruker-JPK NanoWizard III Ultra couplé à un microscope inversé plein champ, BioMat, et technologie FluidFM
  • Bruker BioScope Resolve couplé à un microscope de super-résolution Zeiss Elyra P1
  • Bruker FastScan Bio
  • Bruker Multimode 8

Formations

Des formations peuvent être proposées pour chaque technologie, en fonction des besoins des utilisateurs et des projets.

Accès

Pour la majorité des équipements 3D et microfabrication, une formation initiale est nécessaire pour avoir accès au plateau. Les chercheurs peuvent ensuite réserver et utiliser les équipements de manière autonome. Un accompagnement technique dédié est assuré pour les approches super-résolution et AFM.

Personnel

Responsable scientifique : Alexandre Grassart
Membres : Sébastien Janel (IR CNRS), Elizabeth Werkmeister (IR CNRS)

Plateau de Biostatistique

Le plateau de biostatistique du CIIL accompagne les équipes de recherche du Centre dans l’ensemble des étapes liées à la production, l’exploitation et la valorisation des données expérimentales et cliniques.

Il intervient en amont des projets, avec la définition du plan d’expérience et la réalisation de calcul de puissance. Il assure ainsi une production de données de qualité et optimale pour répondre à la question posée. Cette étape initiale peut être requise dans les dépôts de projet y compris en expérimentation animale.

Il définit et réalise le plan d’analyse en choisissant les méthodes statistiques les plus adaptées aux données et à la question posée. En appliquant un contrôle qualité sur les données et en garantissant la pertinence méthodologique, le plateau assure une production de résultats robustes.

Il collabore étroitement avec le porteur de projet afin d’analyser et d’interpréter le plus finement possible les données et les résultats. Son travail permet de tester des hypothèses ou d’en produire de nouvelles lors de l’exploration de données.

combinaison d’analyses statistiques (classification hiérarchique et analyse factorielle multiple)
[Combinaison d’analyses statistiques (classification hiérarchique et analyse factorielle multiple) pour identifier des sous-groupes d’individus homogènes et les variables qui les caractérisent. Il peut également élaborer des outils et représentations graphiques d’aide à la décision.

Le plateau apporte une expertise en statistique variée allant de l’analyse de petits échantillons à l’intégration de données issues de différentes sources. Ceci requiert l’utilisation de méthodes statistiques non paramétriques tout comme des méthodes multivariées avancées.

Depuis 2020, ce plateau a contribué à huit publications originales du CIIL.

La proximité du plateau avec les équipes de recherche favorise la sensibilisation, la formation et l’harmonisation des pratiques en statistique, ce qui contribue à une production scientifique rigoureuse et de qualité au sein du Centre.

Clustering par kmean
Clustering par kmean indiquant les composés, ici le groupe 1 en rouge, les plus proches de la molécule de référence située en haut à gauche.

Contact : Cécile Lecoeur (cecile.lecoeur@cnrs.fr)