Biologie intégrative des parasites apicomplexes


Mathieu Gissot
Directeur de Recherche - CNRS
ORCID
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Les Apicomplexa constituent un embranchement regroupant des protozoaires parasites unicellulaires, obligatoirement intracellulaires, qui comprend diverses espèces pathogènes pour l'homme telles que Plasmodium spp. (agents responsables du paludisme), Toxoplasma gondii (responsable de la toxoplasmose) et Cryptosporidium spp. (responsable de la cryptosporidiose). Les parasites apicomplexes provoquent des maladies associées à une expansion incontrôlable de la biomasse parasitaire, entraînant une inflammation et la destruction des cellules de l'hôte. Bien que les parasites apicomplexes présentent généralement un cycle sexuel chez l'hôte définitif, la pathogenèse de ces parasites chez l'homme résulte des cycles de réplication asexuée continus au sein des cellules de l'hôte. La persistance chez l'hôte humain et la dissémination vers d'autres hôtes dépendent de la capacité de ces parasites à se différencier en formes capables d'envahir des niches cellulaires spécifiques. La réponse de l'hôte à l'infection est non seulement essentielle pour contrôler la phase aiguë de ces infections, mais elle contribue également à la différenciation des parasites en formes persistantes tout au long de la vie, associées à des pathologies chroniques. Pour surmonter les réponses de l'hôte, se disséminer et persister, les parasites ont donc développé des stratégies visant à moduler les voies immunitaires et métaboliques de l'hôte. Par conséquent, la capacité des parasites apicomplexes à proliférer et à se différencier, ainsi que la capacité de l'hôte à répondre à l'infection, sont cruciales pour la pathogenèse de ces parasites.
Au sein de notre équipe, nous cherchons à comprendre, tant chez Plasmodium que chez T. gondii, les déterminants moléculaires qui régissent la capacité de ces parasites à (i) se multiplier et (ii) persister dans l'hôte. De plus, nous étudions les réponses de l'hôte à l'infection parasitaire. Nous mettons également à profit les connaissances accumulées sur les mécanismes fondamentaux que nous avons décrits afin d'identifier de nouvelles cibles thérapeutiques et de nouveaux composés qui permettront d'élargir l'arsenal thérapeutique destiné à traiter les maladies invalidantes causées par ces parasites.

 

Regulation of gene expression during the parasite cell-cycle and differentiation

Toxoplasma gondii is a responsible for toxoplasmosis, a disease which can be fatal for the fetus of infected mothers and for immunocompromised patients. This parasite belongs to the Apicomplexa family which contains other parasites of medical importance such as Plasmodium (responsible for malaria) or Cryptosporidium (cryptosporidiosis). The pathogenicity of these parasites is based on their ability to divide in order to proliferate in the organism. They have therefore invented simplified division patterns in order to multiply efficiently and quickly while producing a large number of parasites. The mechanisms allowing the control and coordination of these modes of division are therefore essential to their ability to proliferate and therefore to the survival of these parasites in humans. We aim to expand our understanding on how these parasites are able to evolve flexible modes of division allowing them to proliferate in a large number of different organisms. We study the proteins that control and coordinate the division of these parasites, using T. gondii as a model Apicomplexa. We are particularly interested in transcription factors of the ApiAP2 family which coordinate specific expression profiles during the cell cycle. In addition, we also study the centrosome, which serves as a platform coordinating the cell cycle. These studies could lead us to better understand the mechanisms of division in this family of parasites in order to develop new molecules aiming at controlling their proliferation

Project leader : Mathieu Gissot


Les effecteurs de Toxoplasma gondii et la modulation des réponses immunitaires de l'hôte.

Bien qu'ils soient essentiels à l'établissement de l'infection, les mécanismes régissant les échanges entre le parasite et son hôte restent mal compris. Plus précisément, les protéines des granules denses (GRA), qui sont libérées dans l'espace vacuolaire et le cytosol de l'hôte, agissent comme des effecteurs clés qui modulent les défenses immunitaires de la cellule hôte. Ces protéines GRA sont également essentielles à l'établissement de la toxoplasmose chronique, car elles facilitent la formation de kystes dans les neurones. En recourant à la génétique inverse, à la protéomique, à l'imagerie in vivo et à la microscopie à haute résolution, notre objectif est de découvrir et de caractériser de nouvelles voies de sécrétion qui régulent la libération des effecteurs parasitaires et influencent la virulence du parasite.

Du côté de l'hôte, nous nous intéressons à la manière dont l'infection modifie la réponse immunitaire pendant les phases aiguë et latente cérébrale de la maladie. En particulier, nous étudions comment les cellules dendritiques spléniques réagissent à différentes souches du parasite et comment cela affecte la présentation des antigènes et le développement d'une immunité protectrice à long terme. Dans le cerveau, nous examinons l'impact de l'infection latente sur les signatures des cellules immunitaires et comment l'inflammation chronique induite par l'infection peut altérer la fonction neuronale.

Project leader : Sabrina Marion


Le Plasmodium possède un cycle de vie complexe et fascinant, conçu pour s'adapter et survivre chez différents hôtes et dans différents tissus.

Il se transmet entre un vertébré (hôte intermédiaire) et un moustique Anopheles (hôte définitif), où une phase de goulot d'étranglement est rapidement suivie d'une période de réplication, conduisant à la génération de milliers de descendants. Au cours de son développement intracellulaire dans les érythrocytes, il subit une mitose fermée pour se répliquer. Ce processus, appelé schizogonie, implique des événements de réplication de l'ADN asynchrones, aboutit à la formation d'une cellule multinucléée (schizonte) et est suivi d'un bourgeonnement et d'une cytokinèse. Comme on pouvait s'y attendre, la régulation d'un tel cycle de réplication diffère de celle du cycle cellulaire eucaryote. Au sein de notre équipe, nous avons étudié le rôle de la phosphatase PP1 et de ses régulateurs chez Plasmodium et T. gondii. 
Chez les eucaryotes, l'inhibiteur 2 (I2) et SDS22, deux sous-unités régulatrices de la PP1, interviennent dans des étapes clés de la division cellulaire, notamment lors de l'entrée en mitose, de la condensation chromosomique et de la cytokinèse. Nos travaux antérieurs ont montré que, bien que I2 et LRR1 (homologue de SDS22 chez Plasmodium) interagissent avec PP1 et la régulent à la fois chez Plasmodium et chez T. gondii, elles présentent des spécificités au niveau de leur structure et de leur profil de phosphorylation, ce dernier étant connu pour jouer un rôle dans leur régulation. Ces données suggèrent fortement que, chez ces parasites, les deux protéines forment des holoenzymes qui pourraient avoir des fonctions différentes de celles décrites chez les eucaryotes, en particulier lors de la réplication parasitaire. À l'aide de la génétique inverse, notre objectif est d'explorer les fonctions biologiques de I2 et LRR1 ainsi que l'importance de leur régulation par la phosphorylation afin de mettre en lumière la contribution de ces complexes à la régulation de la prolifération parasitaire.

Responsable du projet : Christine Pierrot


Découverte de nouvelles molécules antipaludiques grâce à la caractérisation moléculaire et fonctionnelle des phosphatases spécifiques à Plasmodium falciparum

Plasmodium falciparum (Pf), l'agent pathogène le plus mortel du paludisme, a développé une résistance à presque tous les agents chimiothérapeutiques. Il est nécessaire de comprendre la biologie de ce parasite afin de développer de nouveaux médicaments. Chez Pf, des recherches approfondies ont désormais été lancées pour étudier le kinome de Pf et examiner si le ciblage des kinases pourrait constituer un moyen efficace pour le traitement de l'infection. Cependant, l'étude des phosphatases de Pf reste encore peu explorée. Des analyses comparatives des séquences d'acides aminés de Pf et de Plasmodium berghei (Pb), une espèce de paludisme des rongeurs, ont révélé que plusieurs d'entre elles sont spécifiques à Plasmodium. Parmi ces phosphatases, trois ont également été suggérées comme étant essentielles au développement des parasites de Pf au stade sanguin. Le présent projet se concentre sur la caractérisation moléculaire et fonctionnelle de l'une d'entre elles et sur la validation de cette phosphatase spécifique en tant que nouvelle cible potentielle pour le paludisme. 
Le gène a été cloné, annoté et exprimé sous forme de protéine recombinante, et son activité phosphatase a été démontrée in vitro. La caractérisation fonctionnelle in vivo a été étudiée à travers des études de knock-out génétique conditionnel ainsi que par la génération de lignées parasitaires knock-in afin de suivre leur distribution au cours du cycle de vie du parasite (chez Pf et Pb). Enfin, nous avons déterminé in silico la structure 3D du site catalytique de cette phosphatase par modélisation par homologie et identifié un nouvel ensemble d'inhibiteurs spécifiques potentiels. Une première série de pharmacomodulations nous a permis de découvrir 13 nouveaux composés prometteurs avec une CI50 ≤ 100 nM, dont 3 avec une CI50 ≤ 50 nM. Des études de cytotoxicité ont montré une faible toxicité cellulaire sur des cellules HFF (fibroblastes de prépuce humain) et HepG2 (hépatocytes humains) avec un indice de sélectivité > 100. Actuellement, nous poursuivons la pharmacomodulation de ces composés prometteurs, l'étude de l'interaction molécule-cible et l'évaluation de l'efficacité in vivo dans un modèle animal du paludisme. Notre projet est soutenu par Inserm Transfert et SATT Nord.

Responsable du projet: El-Moukhtar Aliouat

Personnel actuel

 

ALIOUAT El Moukhtar
Professeur - University of Lille
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À propos d'El Moukhtar

BA Mahmoudou
Doctorant
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BRUERE Amandine
Ingénieurs - CDD Inserm

DEWITTE Caroline
Ingénieure d'étude -Institut Pasteur de Lille
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GISSOT Mathieu
Directeur de Recherche - CNRS
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MARION Sabrina
Maître de conférences - University of Lille
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MOUVEAUX Thomas
Ingénieur d'étude - CNRS
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MUDIYAM Venkat
Doctorant
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NADER Peter
PhD student - University of Lille
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PEUCELLE Véronigue 
Ingénieure  - Institut Pasteur de Lille
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PIERROT Christine
Chercheuse - Institut Pasteur de Lille
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REMIA Gaetan
Doctorant
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ROGER Emmanuel
Maître de conférences - Univ Lille
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À propos d' Emmanuel

Marcin PEZINSKI  (2021-2023)
Grant: PTR 474-21 - Réseau international des Instituts Pasteur
Project: Functional analysis of novel centrosomal and basal body components of two human parasitic protozoa

Mohamed Amir KEZAI (2021-2022)
Grant: CPER-CTRL Région Hauts de France
Project: Impact of Toxoplasma-triggered neuro-inflammation and modulation of the kynurenine pathway on Tau pathology

Maika DEFFIEU (2014-2017)
Grant: FEDER, ANR
Project: T. gondii vesicular trafficking and host cell responses

Flavie COURJOL (2014-2017)
Grant: ANR JCJC ToxoVirFT 
Project: Role and composition of the Nuclear pore complex in T. gondii

Maanasa BHASKARAN (2021-2024)
Project: Elucidation of biological role of transcription factors in the regulation of cell cycle in Toxoplasma gondii
Supervisor: Mathieu Gissot
Current position: Postdoctoral fellow, LPHI, Université de Montpellier, France

Lola GURGOGLIONE (2021-2024)
Project: Caractérisation du rôle de IRE1a, un inducteur clé de l’UPR, dans l’activation des réponses immunitaires innées contre Toxoplasma gondii
Supervisor: Sabrina Marion

Justine PETERS (2021-2024)
Project: Conception, synthèse et évaluation pharmacologique de composés antipaludiques ciblant une enzyme spécifique de Plasmodium
Supervisor: El Moukhtar Aliouat (co-supervision)

Claudianne LAINE (2020-2023)
Project: Caractérisation d'un nouvel interactant de PP1 appartenant au complexe protéasome 26S de Plasmodium
Supervisor: Christine Pierrot

Asma-Sarah KHELIFA (2018-2021)
Project: Understanding the role of transcription factors in regulating Toxoplasma gondii crucial cell cycle functions
Supervisor: Mathieu Gissot
Current position: Postdoctoral fellow, Molecular Immunology Group - Center of Immuno-Oncology, National Cancer Institute, Bethesda, USA

Mohamed Amir KEZAI (2018-2020)
Project: Interactions between astrocytes and T.gondii during chronic toxoplasmosis
Supervisor: Sabrina MARION (co-supervision)
Current position : Postdoctoral fellow, Department of Psychiatry and Neuroscience, Laval University, Canada

Thomas MOUVEAUX (2017-2020)
Project: Molecular characterization of new transcriptional regulators in T. gondii.
Supervisor: Mathieu GISSOT

Sylia CHEHADE (2017-2020)
Project: Characterization of the T. gondii Rab11A-dependent secretome and associated host responses
Supervisor: Sabrina MARION

Anaïs PONCET (2016-2019)
Project: Subversion of dendritic cell functions by T. gondii and impact on the protective immunity
Supervisor: Sabrina MARION

Cécilia N’GUESSAN (2016-2019)
Project: Caractérisation moléculaire et fonctionnelle d'une enzyme spécifique de Plasmodium falciparum comme cible anti-malarique potentielle
Supervisor: El Moukhtar ALIOUAT
Current position : Pharmacienne praticienne attachée, AP-HP, Paris

Bénédicte GNANGNON (2015-2019)
Project: Caractérisation moléculaire et fonctionnelle d’une kinase de Plasmodium falciparum: rôle dans la régulation de la Protéine Phosphatase de type 1 ?
Supervisor: Christine PIERROT

Kevin LESAGE (2014-2018)
Project: Caractérisation fonctionnelle et implication du facteur de transcription TgAP2X-5 dans la régulation des gènes de virulence chez Toxoplasma gondii
Supervisor: Mathieu GISSOT

Kannan VENUGOPAL (2013-2017)
Project: Role of the Clathrin Adaptor Complex AP1 and the small GTPase Rab11A in Anterograde Trafficking in Toxoplasma gondii
Supervisor: Sabrina MARION
Current Position: Post-doctoral Fellow, M. Marti laboratory, University of Glasgow, UK

Astrid LENNE (2013-2016)
Project: Caractérisation moléculaire et fonctionnelle de deux nouveaux partenaires potentiels de la Protéine Phosphatase de type 1 (PP1) chez Plasmodium falciparum.
Supervisor: Christine PIERROT
Current position: Postdoctoral fellow, CIIL, Research on Mycobacteria and Bordetella (RMB) Team, Lille

Audrey VANDOMME (2010-2014)
Project: Caractérisation fonctionnelle du PhosphoTyrosyl Phosphatase Activator chez Plasmodium falciparum : rôle dans la régulation de PP2A et de PP1.
Supervisor: Christine PIERROT