ECOPHIP concentre ses activités de recherche sur les protozoaires parasitaires intestinaux Blastocystis et Cryptosporidium, qui représentent actuellement des problèmes socio-économiques et de santé publique majeurs. Les deux parasites sont responsables d'infections gastro-intestinales qui, dans le cas de Cryptosporidium, peuvent être graves voire mortelles chez les enfants et les patients immunodéprimés. Cependant, ces parasites sont encore mal étudiés et généralement négligés par les autorités sanitaires, alors que peu ou pas de traitement est efficace contre ces parasites. Par ailleurs, ces deux parasites, présentant une grande diversité génétique et pouvant coloniser de nombreux hôtes, représentent également des modèles pertinents pour enquêter sur une question biologique majeure dans le domaine de «l'écologie de la santé»: quelle est la nature de la diversité génétique de ces derniers parasites et son impact sur la circulation et la pathogénicité de différentes espèces et génotypes? Les travaux actuels et futurs d'ECOPHIP, qui ont la particularité de combiner «études de terrain» et «recherches en laboratoire», visent à clarifier l'épidémiologie moléculaire de ces parasites, leur circulation dans les populations humaines et animales ainsi que dans l'environnement (recherche de facteurs de risque de transmission) et leur physiopathologie tout en identifiant les molécules et les mécanismes impliqués dans la pathogenèse de ces parasites. L'objectif d'ECOPHIP est de fournir des stratégies pour mettre en place des mesures urgentes de prévention et de contrôle afin de réduire significativement l'incidence des pathogènes. ECOPHIP combine l'épidémiologie moléculaire et la phylogénie, la génomique comparative, la transcriptomique et la protéomique, la métagénomique et les approches de biologie cellulaire et moléculaire ainsi que le développement de modèles d'études in vivo, ex vivo et in vitro. ECOPHIP a développé un vaste réseau bien ciblé de collaborations nationales et internationales. Enfin, en raison de sa rare expertise en protistologie, ECOPHIP est sollicité pour des collaborations spécifiques, notamment dans le cadre de l'identification moléculaire de protozoaires parasitaires d'intérêt pour la santé humaine et animale ou en tant que coordinateur / partenaire de projets financés dans les domaines de la parasitologie (parasites des poissons) et de la parasitologie environnementale .

 

 

Blastocystis & Microbiote

« Eucaryome » intestinal: le rôle particulier des protozoaires dans le microbiote intestinal

La prise de conscience du rôle du microbiote intestinal dans la biologie et la santé de son hôte s'est accrue ces dernières années. Cependant, la plupart des recherches sur le microbiome se concentre sur les bactéries et, dans l'ensemble, nous savons peu de choses sur le rôle des eucaryotes associés à l'hôte en dehors du domaine de la Parasitologie. Pourtant, les microeucaryotes sont des habitants communs de nos intestins rarement associés à des signes cliniques de maladie. Plus particulièrement, notre équipe a mis en évidence que les protozoaires du genre Blastocystis, dont la pathogénicité est controversée, sont associés à des effets positifs sur la diversité bactérienne intestinale et sur la composition du microbiome intestinal, et seraient donc considérés comme des membres d’un microbiote intestinal sain. L’étude de la diversité et du rôle de ces microeucaryotes intestinaux sur la santé humaine et animale est donc un des thèmes de recherche majeurs de l'équipe ECOPHIP. Cette thématique a été ou est financée par la région Hauts-de-France, la SATT du Nord et l'ANSES.

 

CA21105 - Blastocystis under One Health (OneHealthBlastocystis)

L’équipe ECOPHIP est la seule équipe française ayant intégré le programme COST Blastocystis under One Health 2022-2026. Dans ce cadre, le Dr Magali Chabé est membre du comité de gestion et co-responsable du groupe de travail « Collecte et base de données sur Blastocystis ». Le Dr Eric Viscogliosi sera lui impliqué dans le groupe de travail « Cartographie de l'épidémiologie et du diagnostic de la blastocystose»

Description

Blastocystis colonise au moins un milliard de personnes, ce qui en fait le microbe intestinal eucaryote le plus répandu. Des données émergentes indiquent une prévalence plus élevée chez les animaux. Une forte proportion de porteurs sont asymptomatiques. Malgré de nombreuses études, la pathogénicité de Blastocystis reste controversée. Actuellement, au moins 26 sous-types génétiques (ST) existent. Parmi ceux-ci, ST1-ST9 et ST12 ont été trouvés chez l'homme, tandis que les autres n'ont été isolés que chez des hôtes non humains. Les informations sur la prévalence, la distribution géographique et la spécificité de l'hôte des ST sont incomplètes. Des lacunes importantes existent également sur la présence environnementale de Blastocystis. Collectivement, cette rareté de données brouille considérablement le paysage de Blastocystis. Les objectifs spécifiques de ce cadre sont de : (1) Soutenir l'avancement de la recherche sur Blastocystis en réunissant des professionnels de diverses disciplines et pays ; (2) Favoriser le partage d'informations sur les méthodologies actuelles, en particulier dans les domaines du sous-typage, des interactions hôte-Blastocystis-microbiome et Blastocystis-omique ; (3) Promouvoir le renforcement des capacités grâce à un réseau transdisciplinaire de collaboration internationale ; (4) Ouvrir des voies de communication avec les vétérinaires, les médecins et le grand public. À la fin de cette initiative, les participants seront en mesure de : (i) appliquer des outils de pointe pour l'identification moléculaire de Blastocystis ; (ii) Harmoniser les méthodologies de sous-typage de Blastocystis et d'identification de son rôle dans l'intestin ; (iii) Voir Blastocystis dans le cadre de l'approche One Health ; (iv) Générer de nouvelles hypothèses pour tester le rôle de Blastocystis dans l'écosystème intestinal, la santé et la maladie.

Mots-clés
Blastocystis dans la santé et la maladie - Épidémiologie de Blastocystis - Diversité et évolution de Blastocystis - Approche One Health - Blastocystis à l'ère des omiques

Références:


1.    Even G, Lokmer A, Rodrigues J, Audebert C, Viscogliosi E, Segurel L, Chabé M (2021) Changes in the human gut microbiota associated with colonization by Blastocystis sp. and Entamoeba spp. in non-industrialized populations. Front Cell Infect Microbiol 11, 533528. doi: 10.3389/fcimb.2021.533528.
2.      Chabé M, Certad G, Caccio SM. Editorial: Enteric Unicellular Eukaryotic Parasites and Gut Microbiota: Mechanisms and Ecology. Front Microbiol. 2021 Oct 25;12:779412. doi: 10.3389/fmicb.2021.779412. PMID: 34759914; PMCID: PMC8573350.
3.    Lokmer A, Cian A, Froment A, Gantois N, Viscogliosi E, Chabé M, Ségurel L (2019) Use of shotgun metagenomics for the identification of protozoa in the gut microbiota of healthy individuals from worldwide populations with various industrialization levels. PLoS ONE 14, e0211139. doi: 10.1371/journal.pone.0211139.
4.    Siegwald L, Caboche S, Even G, Viscogliosi E, Audebert C, Chabé M (2019) The impact of bioinformatics pipelines on microbiota studies: does the analytical “microscope” affect the biological interpretation? Microorganisms 7, 393. doi: 10.3390/microorganisms7100393.
5.    Chabé M, Lokmer A, Ségurel L (2017) Gut Protozoa: Friends or Foes of the Human Gut Microbiota? Trends Parasitol 33, 925-934. doi: 10.1016/j.pt.2017.08.005.
6.    Siegwald L, Audebert C, Even G, Viscogliosi E, Caboche S, Chabé M (2017) Targeted metagenomic sequencing data of human gut microbiota associated with Blastocystis colonization. Sci Data 4, 170081. doi: 10.1038/sdata.2017.81.
7.    Audebert C, Even G, Cian A; Blastocystis Investigation Group, Loywick A, Merlin S, Viscogliosi E, Chabé M (2016) Colonization with the enteric protozoa Blastocystis is associated with increased diversity of human gut bacterial microbiota. Sci Rep 6, 25255. doi: 10.1038/srep25255.

ECOPHIP à la rencontre des lycéens de la métropole lilloise

Depuis quelques années, ECOPHIP est impliquée dans le programme DECLICS (Dialogue Entre Chercheurs et Lycéens pour les Intéresser à la Construction des Savoirs : www.cerclefser.org/fr/declics/). Mis en place en 2014 par le cercle FSER (Fondation Schlumberger pour l’Education et la Recherche), le programme DECLICS vise à promouvoir la recherche, ses démarches et ses enjeux auprès des jeunes et favoriser l’engagement des personnels de recherche dans le dialogue avec le grand public.

Dans ce cadre, et en collaboration avec le cercle FSER et les professeurs de Sciences de la Vie et de la Terre (SVT), les membres de l’équipe ECOPHIP rencontrent des lycéens de Terminale à orientation scientifique. Cette rencontre se fait en deux phases : une présentation générale des métiers de la recherche et des activités scientifiques de l’équipe visiteuse par le «Capitaine DECLICS » puis un speed-meeting avec les lycéens avec chaque membre de l’équipe (ambassadeurs DECLICS). Lors de ce speed-meeting, les ambassadeurs présentent leur parcours (chercheur, enseignant-chercheur, post-doc, doctorant, ingénieur, technicien, étudiant en médecine, master, licence…) et répondent aux multiples questions des lycéens.

Le 15 décembre dernier, les équipes ECOPHIP (E. Viscogliosi) et Microbiology’s Platypus (D. Devos) ont rencontré une soixantaine de lycéens de Terminale du Lycée Faidherbe de Lille et Mme Henocq, professeur de SVT. De par la diversité des profils des ambassadeurs, cette opération a reçu un vif succès et a peut être créé des vocations.

Présentation des métiers de la recherche et des activités de recherche par le « Capitaine DECLICS » au Lycée Faidherbe de Lille (E. Viscogliosi)

Les « Ambassadeurs DECLICS » au Lycée Faidherbe de Lille (De gauche à droite : Sylvia Viscogliosi, étudiante 3ème année de Médecine / Master; Jeremy Desramaut, Technicien ; Manon Ryckman, Doctorante ; Ruben Garcia Dominguez, Doctorant ; Constance Denoyelle, Doctorante ; Angéline Reboul, Post-doc ; Magali Chabé, MCU ; Gabriela Certad, Chercheur ; Nausicaa Gantois, Chargée d’étude ; Eric Viscogliosi, DR CNRS).

Cryptosporidium et cancer digestif

Cryptosporidium est un parasite apicomplexa intracellulaire considéré comme l'une des principales causes de diarrhées dans le monde. Cependant, malgré la forte exposition de l’homme comme des animaux à ce parasite ubiquitaire., peu d'attention a été accordée à son potentiel tumorigène En effet, notre équipe a découvert que Cryptosporidium parvum (C. parvum) peut induire des adénocarcinomes gastro-intestinaux et biliaires invasifs dans un modèle de souris SCID (severe combined immunodeficiency) dès 20 jours post-infection (selon la souche de C. parvum administrée). De plus, nous avons également pu montrer le développement de néoplasies intraépithéliales de bas grade dans un modèle intestinal ex vivo infecté par C. parvum. Enfin, des études épidémiologiques récentes ont montré une forte prévalence de l'infection par Cryptosporidium chez les patients atteints d'un cancer gastro-intestinal récemment diagnostiqué et avant tout traitement. L’ensemble de ces arguments expérimentaux et cliniques nous a poussé à concentrer nos recherches sur l'étude de la physiopathologie de Cryptosporidium et l'identification de la signature moléculaire du cancer digestif induit par ce parasite.

Adénocarcinome au niveau de la région iléocaecal induit par Cryptosporidium parvum. A :  Aspect macroscopique de la lésion ; B et C : Aspects microscopiques de la lésion (Hematoxyline & Eosine). D : C. parvum infectant une cellule épithéliale en microscopie électronique. Bar (µm) = A : 1 000 ; B : 400 ; C : 25 ; D : 0,4. D'après Benamrouz et al. 2012.

 

Références:

* Sawant M, Benamrouz-Vanneste S, Meloni D, Gantois N, Even G, Guyot K, Creusy C, Duval E, Wintjens R, Weitzman J, Chabé M, Viscogliosi E, Certad G. Putative SET-domain methyltransferases in Cryptosporidium parvum and histone methylation during infection. Virulence 2022 ; 13, 1632-1650. doi: 10.1080/21505594.2022.2123363.

* Sawant M, Benamrouz-Vanneste S, Mouray A, Bouquet P, Gantois N, Creusy C, Duval E, Mihalache A, Gosset P, Chabé M, Hot D, Viscogliosi E, Certad G. Persistent Cryptosporidium parvum infection leads to the development of the tumor microenvironment in an experimental mouse model: results of a microarray approach. Microorganisms 2021; 9, 2569. doi: 10.3390/microorganisms9122569.

* Audebert C, Bonardi F, Caboche S, Guyot K, Touzet H, Merlin S, Gantois N, Creusy C, Meloni D, Mouray A, Viscogliosi E, Certad G, Benamrouz-Vanneste S, Chabé M. Genetic basis for virulence differences of various Cryptosporidium parvum carcinogenic isolates. Sci Rep 2020 ; 10, 7316. doi: 10.1038/s41598-020-64370-0.

* Baydoun M, Treizeibre A, Follet J, Benamrouz-Vanneste S, Creusy C, Delaire B, Mouray A, Viscogliosi E, Certad G, Senez V. An interphase microfluidic culture system for the study of ex vivo intestinal tissue. Micromachines. 2020 ; 11, 150. doi: 10.3390/mi11020150.

* Sawant M, Baydoun M, Creusy C, Chabé M, Viscogliosi E, Certad G, Benamrouz-Vanneste S. Cryptosporidium and Colon Cancer: Cause or Consequence? Microorganisms. 2020 ; 8 (11):E1665. doi: 10.3390/microorganisms8111665.

* Osman M, Benamrouz S, Guyot K, Baydoun M, Frealle E, Chabe M, Gantois N, Delaire B, Goffard A, Aoun A, Jurdi N, Dabboussi F, Even G, Slomianny C, Gosset P, Hamze M, Creusy C, Viscogliosi E, Certad G. High association of Cryptosporidium spp. infection with colon adenocarcinoma in Lebanese patients. PLoS One. 2017; 12(12):e0189422. doi: 10.1371/journal.pone.0189422.  

* Baydoun M, Vanneste SB, Creusy C, Guyot K, Gantois N, Chabe M, Delaire B, Mouray A, Baydoun A, Forzy G, Chieux V, Gosset P, Senez V, Viscogliosi E, Follet J, Certad G. Three-dimensional (3D) culture of adult murine colon as an in vitro model of cryptosporidiosis: Proof of concept. Sci Rep. 2017; 7(1):17288. doi: 10.1038/s41598-017-17304-2.

* Cheeseman K, Certad G, Weitzman JB. Parasites and cancer: is there a causal link? Med Sci (Paris). 2016; 32(10):867-873. doi: 10.1051/medsci/20163210020.

* Benamrouz S, Conseil V, Chabé M, Praet M, Audebert C, Blervaque R, Guyot K, Gazzola S, Mouray A, Chassat T, Delaire B, Goetinck N, Gantois N, Osman M, Slomianny C, Dehennaut V, Lefebvre T, Viscogliosi E, Cuvelier C, Dei-Cas E, Creusy C, Certad G. Cryptosporidium parvum-induced ileo-caecal adenocarcinoma and Wnt signaling in a mouse model. Dis Model Mech. 2014;7(6):693-700. doi: 10.1242/dmm.013292.

* Benamrouz S, Guyot K, Gazzola S, Mouray A, Chassat T, Delaire B, Chabé M, Gosset P, Viscogliosi E, Dei-Cas E, Creusy C, Conseil V, Certad G. Cryptosporidium parvum infection in SCID mice infected with only one oocyst: qPCR assessment of parasite replication in tissues and development of digestive cancer. PLoS One. 2012; 7(12):e51232. doi: 10.1371/journal.pone.0051232.

* Benamrouz S, Conseil V, Creusy C, Calderon E, Dei-Cas E, Certad G. Parasites and malignancies, a review, with emphasis on digestive cancer induced by Cryptosporidium parvum (Alveolata: Apicomplexa). Parasite. 2012;19(2):101-15. doi: 10.1051/parasite/2012192101.

* Certad G, Benamrouz S, Guyot K, Mouray A, Chassat T, Flament N, Delhaes L, Coiteux V, Delaire B, Praet M, Cuvelier C, Gosset P, Dei-Cas E, Creusy C Fulminant cryptosporidiosis after near-drowning: a human Cryptosporidium parvum strain implicated in invasive gastrointestinal adenocarcinoma and cholangiocarcinoma in an experimental model. Appl Environ Microbiol. 2012;78(6):1746-51. doi: 10.1128/AEM.06457-11.

* Certad G, Creusy C, Guyot K, Mouray A, Chassat T, Delaire B, Pinon A, Sitja-Bobadilla A, Alvarez-Pellitero P, Praet M, Cuvelier C, Dei-Cas E. Fulminant cryptosporidiosis associated with digestive adenocarcinoma in SCID mice infected with Cryptosporidium parvum TUM1 strain. Int J Parasitol. 2010; 40(13):1469-75. doi: 10.1016/j.ijpara.2010.07.007.

* Certad G, Creusy C, Ngouanesavanh T, Guyot K, Gantois N, Mouray A, Chassat T, Flament N, Fleurisse L, Pinon A, Delhaes L, Dei-Cas E. Development of Cryptosporidium parvum-induced gastrointestinal neoplasia in severe combined immunodeficiency (SCID) mice: severity of lesions is correlated with infection intensity. Am J Trop Med Hyg. 2010 Feb;82(2):257-65. doi: 10.4269/ajtmh.2010.09-0309.

* Certad G, Ngouanesavanh T, Guyot K, Gantois N, Chassat T, Mouray A, Fleurisse L, Pinon A, Cailliez JC, Dei-Cas E, Creusy C. Cryptosporidium parvum, a potential cause of colic adenocarcinoma. Infect Agent Cancer. 2007; 2:22. doi: 10.1186/1750-9378-2-22.

 

Développement d'un kit de prédiction de la santé bovine

Blastocystis, le protozoaire le plus fréquemment retrouvé dans les selles humaines, est de plus en plus reconnu comme un membre commensal de notre microbiote intestinal, associé à des caractéristiques d'un intestin sain, comme une diversité bactérienne intestinale accrue chez les individus asymptomatiques. Grâce à une collaboration avec GD Biotech (spin-off de Genes Diffusion, une société spécialisée dans la sélection génomique du bétail), nous avons eu l'opportunité de tester l'impact de Blastocystis dans le microbiote fécal de vaches laitières. Comme chez l'homme, nous avons démontré que l’alpha-diversité bactérienne était plus élevée dans le microbiote fécal des vaches colonisées par Blastocystis que dans celui des vaches non colonisées. De plus, en étudiant spécifiquement les génisses, nous avons constaté que la présence de Blastocystis chez les vaches au stade génisse était associée à une longévité productive supérieure de 22 %, sans compromettre le rendement laitier quotidien, et à un impact carbone par kg de lait produit inférieur de 17,5 % à celle des vaches laitières exemptes de Blastocystis. Nous avons donc pu conclure que Blastocystis était un indicateur précoce de la longévité productive des vaches laitières et qu'elle pouvait contribuer à limiter les émissions de CH4 du bétail. Ce résultat est devenu une invention, que nous avons protégée par un brevet européen (N° EP22212049.5), actuellement soumis en PCT (N° WO 2024/121284 A1).

Références

Brevet Européen N° EP22212049.5 intitulé: Blastocystis sp. as a Predictive Biomarker of High Productive Longevity in Dairy Heifers). Dépôt de brevet international en cours (PCT/EP2023/084652 Publication internationale N° WO 2024/121284 A1.). Licence exclusive signée entre la SATT-Nord et la SAS Gènes Diffusion au travers de sa filiale GD Biotech, pour le développement d’un kit de dépistage de ce biomarqueur prédictif de santé et de longévité productive chez les bovins.

* Innovation lauréate du Sommet d’Or (concours innovation) au Sommet de l’élevage 2024, Clermont-Ferrand, France. L’outil prédictif de la longévité productive des vaches laitières COWBIOT (https://www.lecourrierdesentreprises.fr/linnovation-au-sommet/)

* Communiqués de presse

 

ECOPHIP en visite au Vietnam

ECOPHIP poursuit la structuration de son réseau de collaborations internationales à travers le monde en particulier en Asie du Sud-Est. Le Dr Eric Viscogliosi et le Dr Gabriela Certad se sont ainsi rendus au Vietnam à deux reprises pour rencontrer leurs collègues des Instituts Pasteur de Nha Trang et d’Ho Chi Minh Ville dans le cadre du Programme de Coopération Scientifique financé par l’Ambassade de France au Vietnam. Un projet collaboratif focalisé sur l’épidémiologie moléculaire et la circulation des protozoaires intestinaux sous une approche « Une santé » a été initié complété par la venue prochaine d’étudiants vietnamiens à l’Institut Pasteur de Lille.

L’Institut Pasteur d’Ho Chi Minh Ville. Les bustes de Calmette et Pasteur à l’Institut Pasteur d’Ho Chi Minh Ville.

L’Institut Pasteur de Nha Trang

Publications 2018-2024

Original Articles

Jelassi R, Chelbi H, Certad G, Benamrouz S, Farah F, Bouratbine A, Aoun K. Prévalence élevée d’infection par Cryptosporidium chez des patients atteints de cancer colorectal en Tunisie (2024). Med Trop Sante Int in press

Naguib D, Gantois N, Desramaut J, Garcia Dominguez R, Arafat N, Adwa SM, Even G, Devos DP, Certad G, Chabé M, Viscogliosi E (2024) Large-scale molecular epidemiological survey of Blastocystis sp. among herbivores in Egypt and assessment of potential zoonotic risk. Microorganisms 12, 1286

Ryckman M, Gantois N, Garcia Dominguez R, Desramaut J, Li LL, Even G, Audebert C, Devos DP, Chabé M, Certad G, Monchy S, Viscogliosi E (2024)Molecular identification and subtype analysis of Blastocystis sp. isolates from wild mussels (Mytilus edulis) in Northern France. Microorganisms 12, 710

Certad G, Gantois N, Merlin S, Martel S, Even G, Viscogliosi E, Audebert C, Chabé M (2024) Frequency and molecular identification of Cryptosporidium in adult Prim’Holstein dairy cattle farms in the North of France. Microorganisms 12, 335

Barbier E, Carpentier J, Simonin O, Gosset P, Platel A, Happillon M, Alleman LY, Perdrix E, Riffault V (2023) Oxidative stress and inflammation induced by air pollution-derived PM2.5 persist in the lungs of mice after cessation of their sub-chronic exposure. Environ Int 181, 108248

Cherif MS, Keita M, Dahal P, Guilavogui T, Beavogui AH, Diassy L, Conde M, Touré A, Delamou A (2023) Neglected tropical diseases in Republic of Guinea: disease endemicity, case burden and the road towards the 2030 target. Int Health 15, 490-504

Even G, Mouray A, Vandenabeele N, Martel S, Merlin S, Lebrun-Ruer S, Chabé M, Audebert C (2023) Bact-To-Batch: a microbiota-based tool to determine optimal animal allocation in experimental designs. Int J Mol Sci 24, 7912

Folcher A, Gordienko D, Iamshanova O, Bokhobza A, Shapovalov G, Kannancheri-Puthooru D, Mariot P, Allart L, Desruelles E, Spriet C, Diez R, Oullier T, Marionneau-Lambot S, Brisson L, Geraci S, Impheng H, Lehen'kyi V, Haustrate A, Mihalache A, Gosset P, Chadet S, Retif S, Laube M, Sobilo J, Lerondel S, Villari G, Serini G, Fiorio Pla A, Roger S, Fromont-Hankard G, Djamgoz M, Clezardin P, Monteil A, Prevarskaya N (2023) NALCN-mediated sodium influx confers metastatic prostate cancer cell invasiveness. EMBO J 42, e112198

Guilavogui T, Verdun S, Koïvogui A, Viscogliosi E, Certad G (2023) Prevalence of intestinal parasitosis in Guinea: Systematic review of the literature and meta-analysis. Pathogens 12, 336

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Guilavogui T, Gantois N, Even G, Desramaut J, Dautel E, Denoyelle C, Cissé FI, Touré SC, Kourouma BL, Sawant M, Chabé M, Certad G, Viscogliosi E (2022) Detection, molecular identification and transmission of the intestinal protozoa Blastocystis sp. in Guinea from a large-scale study conducted in the Conakry area. Microorganisms 10, 446

Haustrate A, Mihalache A, Cordier C, Gosset P, Prevarskaya N, Lehen'kyi V (2022) A novel anti-TRPV6 antibody and its application in cancer diagnosis in vitro. Int J Mol Sci 24, 419

Kalach N, Zrinjka M, Bontems P, Kori M, Homan M, Cabral J, Casswall T, Chong S, Cilleruelo ML, Faraci S, Megraud F, Papadopoulou A, Pehlivanoglu E, Raymond J, Rea F, Maria R, Roma E, Tavares M, Ugras M, Urbonas V, Urruzuno P, Gosset P, Creusy C, Delebarre M, Verdun S, on behalfthe ESPGHAN-Helicobacter pyloriSpecialInterest Group (ESPGHAN- H. pylori-SIG) (2022) Systematic review and meta-analysis of histological gastric biopsy aspects according to the updated Sydney system in children. J Pediatr Gastroenterol Nutr 74, 13-19

Li LL, Delgado-Viscogliosi P, Gerphagnon M, Viscogliosi E, Christaki U, Sime-Ngando T, Monchy S (2022) Taxonomic and functional dynamics during chytrid epidemics in an aquatic ecosystem. Mol Ecol 31, 5618-5634

Naguib D, Gantois N, Desramaut J, Arafat N, Even G, Certad G, Chabé M, Viscogliosi E (2022) Prevalence, subtype distribution and zoonotic significance of Blastocystis sp. isolates from poultry, cattle and pets in Northern Egypt. Microorganisms 10, 2259

Sawant M, Benamrouz-Vanneste S, Meloni D, Gantois N, Even G, Guyot K, Creusy C, Duval E, Wintjens R, Weitzman J, Chabé M, Viscogliosi E, Certad G (2022) Putative SET-domain methyltransferases in Cryptosporidium parvum and histone methylation during infection. Virulence13, 1632-1650

Cissé OH, Ma L, Dekker JP, Khil PP, Youn JH, Brenchley JM, Blair R, Pahar B, Chabé M, Van Rompay KKA, Keesler R, Sukura A, Hirsch V, Kutty G, Liu Y, Li P, Chen J, Song J, Weissenbacher-Lang C, Xu J, Upham NS, Stajich JE, Cuomo CA, Cushion MT, Kovacs JA (2021) Genomic insights into the host specific adaptation of the Pneumocystis genus. Commun Biol 4, 305

Cuffaro B, Assohoun ALW, Boutillier D, Peucelle V, Desramaut J, Boudebbouze S, Croyal M, Waligora-Dupriet AJ, Rhimi M, Grangette C, Maguin E (2021) Identification of new potentialbiotherapeuticsfromhuman gut microbiota-derivedbacteria. Microorganisms 9, 565

Even G, Lokmer A, Rodrigues J, Audebert C, Viscogliosi E, Segurel L, Chabé M (2021) Changes in the human gut microbiota associated with colonization by Blastocystis sp. and Entamoeba spp. in non-industrialized populations. Front Cell Infect Microbiol 11, 533528

Gantois N, Lesaffre A, Durand-Joly I, Bautin N, Le Rouzic O, Nseir S, Reboux G, Scherer E, Aliouat EM, Fry S, Gosset P, Fréalle E (2021) Factors associated with Pneumocystis colonisation and circulating genotypes in chronic obstructive pulmonary disease patients with acute exacerbation or at stable state and their homes. Med Mycol60, myab070

Khaled S, Gantois N, Ayoubi A, Even G, Sawant M, El Houmayraa J, Nabot M, Benamrouz-Vanneste S, Chabé M, Certad G, El Safadi D, Daboussi F, Hamze M, Viscogliosi E (2021) Blastocystis sp. prevalence and subtypes distribution amongst Syrian refugee communities living in North Lebanon. Microorganisms 9, 184

Landman WJM, Gantois N, Sawant M, Majoor M, van Eck JHH, Viscogliosi E (2021) Prevalence of trichomonads in the cloaca of wild wetland birds in the Netherlands. Avian Pathol 50, 465-476

Latinne A, Chen HW, Kuo CC, Singleton G, Stuart A, Malbas FF, Demanche C, Chabé M, Michaux J, Morand S (2021). Revisiting the Pneumocystis host specificity paradigm and transmission ecology in wild Southeast Asian rodents. Infect Genet Evol 93, 104978

Pérez-Cruz M, Koné B, Porte R, Carnoy C, Tabareau J, Gosset P, Trottein F, Sirard JC, Pichavant M, Gosset P (2021) The Toll-Like Receptor 5 agonist flagellin prevents Non-typeable Haemophilus influenzae-induced infection in cigarette smoke-exposed mice. PLoS One 16, e0236216

Razakandrainibe R, Mérat C, Kapel N, Sautour M, Guyot K, Gargala G, Ballet JJ, Le Pape P, French Cryptosporidiosis Network, Dalle F, Favennec L (2021) Multicenter evaluation of an ELISA for the detection of Cryptosporidium spp. antigen in clinical human samples. Microorganisms9, 209

Sawant M, Benamrouz-Vanneste S, Mouray A, Bouquet P, Gantois N, Creusy C, Duval E, Mihalache A, Gosset P, Chabé M, Hot D, Viscogliosi E, Certad G (2021) Persistent Cryptosporidium parvum infection leads to the development of the tumor microenvironment in an experimental mouse model: results of a microarray approach. Microorganisms 9, 2569

ACCESS-SMC Partnership (including Guilavogui T) (2020) Effectiveness of seasonal malaria chemoprevention at scale in west and central Africa: an observationalstudy. Lancet 396, 1829-1840

Al Zallouha M, Landkocz Y, Méausoone C, Ledoux F, Visade F, Cazier F, Martin PJ, Borgie M, Vitagliano JJ, Trémolet G, Cailliez JC, Gosset P, Courcot D, Billet S (2020) A prospective pilot study of the T-lymphocyte response to fine particulate matter exposure. J Appl Toxicol 40, 619-630

Audebert C, Bonardi F, Caboche S, Guyot K, Touzet H, Merlin S, Gantois N, Creusy C, Meloni D, Mouray A, Viscogliosi E, Certad G, Benamrouz-Vanneste S, Chabé M (2020) Genetic basis for virulence differences of various Cryptosporidium parvum carcinogenic isolates. Sci Rep 10, 7316

Baydoun M, Treizeibre A, Follet J, Benamrouz-Vanneste S, Creusy C, Delaire B, Mouray A, Viscogliosi E, Certad G, Senez V (2020) An interphase microfluidic culture system for the study of ex vivo intestinal tissue. Micromachines 11, 150

Beavogui AH, Camara A, Delamou A, Diallo MS, Doumbouya A, Kourouma K, Bouedouno P, Guilavogui T, Dos Santos Souza S, Kelley J, Talundzic E, Fofana A, Plucinski MM (2020) Efficacyand safety of artesunate-amodiaquine and artemether-lumefantrine and prevalence of molecular markers associatedwithresistance, Guinea: an open-label two-arm randomisedcontrolled trial. Malar J. 19, 223

Certad G, Zahedi A, Gantois N, Sawant M, Creusy C, Duval E, Benamrouz-Vanneste S, Ryan U, Viscogliosi E (2020) Molecular characterization of novel Cryptosporidium fish genotypes in edible marine fish. Microorganisms 8, 2014

Costa D, Razakandrainibe R, Valot S, Vannier M, Sautour M, Basmaciyan L, Gargala G, Viller V, Lemeteil D, Ballet JJ; French National Network on Surveillance of Human Cryptosporidiosis, Dalle F, Favennec L (2020) Epidemiology of cryptosporidiosis in France from 2017 to 2019. Microorganisms 8: 1358

Cuffaro B, Assohoun ALW, Boutillier D, Súkeníková L, Desramaut J, Boudebbouze S, Salomé-Desnoulez S, Hrdý J, Waligora-Dupriet AJ, Maguin E, Grangette C (2020) In vitrocharacterization of gut microbiota-derived commensal strains: selection of Parabacteroidesdistasonisstrainsalleviating TNBS-inducedcolitis in mice. Cells 2020 9, 2104

Gantois N, Lamot A, Seesao Y, Creusy C, Li L-L, Monchy S, Benamrouz-Vanneste S, Karpouzopoulos J, Bourgain J-L, Rault C, Demaret F, Baydoun M, Chabé M, Fréalle E, Aliouat-Denis CM, Gay M, Certad G, Viscogliosi E (2020) First report on the prevalence and subtype distribution of Blastocystis sp. in edible marine fish and marine mammals: a large scale-study conducted in Atlantic Northeast and on the coasts of northern France. Microorganisms 8: 460

Khaled S, Gantois N, Tidjany Ly A, Senghor S, Even G, Dautel E, Dejager R, Sawant M, Baydoun M, Benamrouz-Vanneste S, Chabé M, Ndiaye S, Schacht AM, Certad G, Riveau G, Viscogliosi E (2020) Prevalence and subtype distribution of Blastocystis sp. in Senegalese school children. Microorganisms 8: 1408

Lecureur V, Monteil C, Jaguin M, Cazier F, Preterre D, Corbière C, Gosset P, Douki T, Sichel F, Fardel O (2020) Comparative study on gene expression profile in rat lung after repeated exposure to diesel and biodiesel exhausts upstream and downstream of a particle filter. Environ Pollut 266, 115264

Ma L, Chen Z, Huang D, Cisse O, Rothenburger J, Latinne A, Bishop L, Blair R, Brenchley J, Chabé M, Deng X, Hirsch V, Keesler R, Kutty G, Liu Y, Margolis D, Morand S, Pahar B, Peng L, Rompay KV, Song X, Song J, Sukura A, Thapar S, Wang H, Weissenbacher-Lang C, Xu J, Lee CH, Jardine C, Lempicki R, Cushion M, Cuomo C, Kovacs J (2020) Diversity and complexity of the large surface protein family in the compacted genomes of multiple Pneumocystis species. mBio 3, 11

Soret P, Vandenborght LE, Francis F, Coron N, Enaud R, The Mucofong Investigation Group (Chabé M, Audebert C, Durand-Joly I, Boldron A, Pin I, Cognet O, Pelloux H, Prevotat A, Wallaert B, Wizla N, Thumerelle C, Turck D), Avalos M, Schaeverbeke T, Berger P, Fayon M, Thiébaut R, Delhaes L (2020) Respiratory mycobiome and suggestion of inter-kingdom network during acute pulmonary exacerbation in cystic fibrosis. Sci Rep10, 3589

Ahangari D, Gillard M, Certad G, Bataille M, Lasek A, Modiano P (2019) Scurvy presenting as pseudo-scleroderma of the leg. JAAD Case Rep 5, 831-833

Bello-Gil D, Audebert C, Olivera-Ardid S, Pérez-Cruz M, Even G, Khasbiullina N, Gantois N, Shilova N, Merlin S, Costa C, Bovin N, Mañez R (2019) The formation of glycan-specific natural antibodies repertoire in GalT-KO mice is determined by gut microbiota. Front Immunol 10, 342

Certad G, Follet J, Gantois N, Hammouma-Ghelboun O, Guyot K, Benamrouz-Vanneste S, Fréalle E, Seesao Y, Delaire B, Creusy C, Even G, Verrez-Bagnis V, Ryan U, Gay M, Aliouat-Denis CM, Viscogliosi E (2019) Prevalence, molecular identification, and risk factors for Cryptosporidium infection in edible marine fish: a survey across sea areas surrounding France. Front Microbiol 10, 1037

Greige S, El Safadi D, Khaled S, Gantois N, Baydoun M, Chemaly M, Benamrouz-Vanneste S, Chabé M, Osman M, Certad G, Hamze M, Viscogliosi E (2019) First report on the prevalence and subtype distribution of Blastocystis sp. in dairy cattle in Lebanon and assessment of zoonotic transmission risk. Acta Trop 194, 23-29

Greige S, Rivoal K, Osman M, El Safadi D, Dabboussi F, El Hage R, Viscogliosi E, Hamze M, Chemaly M (2019) Prevalence and genetic diversity of Campylobacter spp. in the production chain of broiler chickens in Lebanon and its association with the intestinal protozoan Blastocystis sp. Poultry Sci 98, 5883-5891

Landman WJM, Gantois N, van Eck JHH, van der Heijden HMJF, Viscogliosi E (2019) Tetratrichomonas gallinarum granuloma disease in a flock of free range layers. Vet Q 39, 153-160

Lokmer A, Cian A, Froment A, Gantois N, Viscogliosi E, Chabé M, Ségurel L (2019) Use of shotgun metagenomics for the identification of protozoa in the gut microbiota of healthy individuals from worldwide populations with various industrialization levels. PLoS ONE 14, e0211139

Siegwald L, Caboche S, Even G, Viscogliosi E, Audebert C, Chabé M (2019) The impact of bioinformatics pipelines on microbiota studies: does the analytical “microscope” affect the biological interpretation? Microorganisms 7, 393

Zaylaa M, Alard J, Kassaa IA, Peucelle V, Boutillier D, Desramaut J, Rosenstiel P, Nguyen HTT, Dabboussi F, Pot B, Grangette C. (2019) Autophagy: A novel mechanism involved in the anti-inflammatory abilities of probiotics. Cell Physiol Biochem 53, 774-793

Aliouat EM, Dei-Cas E, Gantois N, Pottier M, Pinçon C, Hawser S, Lier A, Huang DB (2018) In vitro and in vivo activity of iclaprim, a diaminopyrimidine compound, a potential therapeutic alternative against Pneumocystis pneumonia. Eur J Clin Microb Infect Dis 37, 409-415

Billet S, Landkocz Y, Martin PJ, Verdin A, Ledoux F, Lepers C, André V, Cazier F, Sichel F, Shirali P, Gosset P, Courcot D (2018) Chemical characterization of fine and ultrafine PM, direct and indirect genotoxicity of PM and their organic extracts on pulmonary cells. J Environ Sci (China) 71, 168-178

Dauchy C, Bautin N, Nseir S, Reboux G, Wintjens R, Le Rouzic O, Sendid B, Viscogliosi E, Le Pape P, Arendrup MC, Gosset P, Fry S, Fréalle E (2018) Emergence of Aspergillus fumigatus azole-resistance in azole-naïve COPD patients and their homes. Indoor Air 28, 298-306

Douki T, Corbière C, Preterre D, Martin PJ, Lecureur V, André V, Landkocz Y, Pottier I, Keravec V, Fardel O, Moreira-Rebelo S, Pottier D, Vendeville C, Dionnet F, Gosset P, Billet S, Monteil C, Sichel F (2018) Comparative study of diesel and biodiesel exhausts on lung oxidative stress and genotoxicity in rats. Environ Pollut 235, 514-524

Fougère B, Landkocz Y, Lepers C, Martin PJ, Armand L, Grossin N, Verdin A, Boulanger E, Gosset P, Sichel F, Shirali P, Billet S (2018) Influence of aging in the modulation of epigenetic biomarkers of carcinogenesis after exposure to air pollution. Exp Gerontol 110, 125-132

Greige S, El Safadi D, Becu N, Gantois N, Pereira B, Chabé M, Benamrouz-Vanneste S, Certad G, El Hage R, Chemaly M, Monzer H, Viscogliosi E (2018) Prevalence, subtype distribution and zoonotic potential of Blastocystis sp. isolates from poultry in Lebanon. Parasit Vectors 11, 389

Latinne A, Bezé F, Delhaes L, Pottier M, Gantois N, Nguyen J, Blasdell K, Dei-Cas E, Morand S, Chabé M (2018) Genetic diversity and evolution of Pneumocystis fungi infecting wild Southeast Asian murid rodents. Parasitology 145, 885-900

Osman M, Benamrouz S, Guyot K, El Safadi D, Mallat H, Dabboussi F, Hamze M, Viscogliosi E, Certad G (2018) Molecular epidemiology of Cryptosporidium spp. in North Lebanon. J Infect Dev Ctries 12, 34S

 

Reviews

Audebert C, Even G, Vandenabeele N, Mouray A, Chabé M (2023) A novel strategy taking gut microbiota fingerprints into account for robust and reproducible animal experiments. Med Sci (Paris) 39, 934-936

Certad G (2022) Is Cryptosporidium a hijacker able to drive cancer cell proliferation? Food Waterborne Parasitol27, e00153

Certad G (2021) Cryptosporidium and colon cancer. Encyclopedia 4258

Sawant M, Benamrouz S, Chabé M, Guyot K, Costa D, Favennec L, Gargala G, Viscogliosi E, Certad G (2020) La cryptosporidiose et son impact en santé publique. Rev Biol Med 352, 53-68

Sawant M, Baydoun M, Creusy C, Chabé M, Viscogliosi E, Certad G, Benamrouz-Vanneste S (2020) Cryptosporidium and colon cancer: cause or consequence? Microorganisms 8, e1665

Demanche C, Guillot J, Chabé M (2019) Pneumocystis species co-evolution: state-of-the-art review. OBM Genetics 3, 13

 

Editorials, commentaries, correspondences and perspectives

Certad G, Viscogliosi E (2021). Editorial for the Special Issue: Epidemiology, transmission, cell biology and pathogenicity of Cryptosporidium. Microorganisms 9, 511

Chabé M, Certad G, Caccio SM (2021) Editorial: Enteric unicellular eukaryotic parasites and gut microbiota: mechanisms and ecology. Front Cell Infect Microbiol 12, 779412

 

Patent

European patent (Application number EP22212049.5 entitled “Blastocystis sp. as a Predictive Biomarker of High Productive Longevity in Dairy Heifers”) extended to the international phase (PCT/EP2023/084652), International Publication Number WO 2024/121284 A1.

 

Congresses

 

National

2020. Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique, Montpellier, France. WAWRZYNIAK, I., CIAN, A., NOURRISSON, C., BART, A., CHABE, M., POIRIER, P., VAN GOOL, T., PEYRETAILLADE, E., VISCOGLIOSI, E., DELBAC, F. Draft genome sequences of Blastocystis subtypes 1 and 8, and comparative analysis.

2022. GIVRE Day (Groupe Pour la Valorisation et la Réflexion autour des Enseignements), Lille, France. ALIOUAT-DENIS, C.M., POTEAUX Y., CHABE, M. Synthèse et améliorations de la mise en place des mises situations à l'officine pédagogique.

2024. Congrès de la Société Française de Parasitologie, Angers, France. DENOYELLE, C., GANTOIS, N., GARCIA DOMINGUEZ, R., WINTJENS, R., DESRAMAUT, J., CERTAD, G., DEVOS, D.P., CHABE, M., VISCOGLIOSI, E. Molecular, structural and functional characterization of the superoxide dismutases of the enteric protozoa Blastocystis.

2024. Congrès de la Société Française de Parasitologie, Angers, France. RYCKMAN, M.,GANTOIS, N., GARCIA DOMINGUEZ, R., DESRAMAUT, J., EVEN, G., AUDEBERT, C., DEVOS, D.P., CHABE, M.,CERTAD, G., MONCHY, S., VISCOGLIOSI, E. Molecular identification and subtype analysis of Blastocystis sp. isolates in wild mussels (Mytilus edulis) in the area of Boulogne-sur-mer in Northern France.

2024. Congrès de la Société Française de Parasitologie, Angers, France. CHABE, M., GANTOIS, N., MERLIN, S., EVEN, G., VISCOGLIOSI, E., AUDEBERT, C. Blastocystis in cattle: the unknown hero.

2024. SOCEPA 2024 - XXIII Congreso de la Sociedad Española de Parasitología, Madrid, Espagne. GARCIA-LIVA, K., MARTIN-CARILLO, N., CERTAD, G., GANTOIS, N., DESRAMAUT, J., VISCOGLIOSI, E., FORONDA, P. Detección de Blastocystis sp. en peces de interés comercial en las Islas Canarias

2024. Congrès de la Société Française de Microbiologie, Lille, France. ALIOUAT-DENIS, C.M., AZOUAR, N., BONNAZ, Y., CARNOY, C., CHABE, M., DIENNE, T., FOLIGNE, B., GILLOT, S., GOFFARD, A., GRIMBERT, N., HERMANN, E., ODOU, M.F., QUELENNEC, K., RAVAUX, P. Travel Pursuit, un jeu sérieux pour voyager en bonne santé.

 

International

2018. 19th International Congress of the Lebanese Society for Infectious Diseases and Clinical Microbiology, Beirut, Lebanon. OSMAN, M., BENAMROUZ, S., GUYOT, K., EL SAFADI, D., MALLAT, H., DABBOUSSI, F., HAMZE, M., VISCOGLIOSI, E., CERTAD, G. Molecular epidemiology of Cryptosporidium spp. in North Lebanon. J. Infect. Dev. Ctries, 12, 34S.

2018. SQUAD2 Sécurité et Qualité Agroalimentaire, Tripoli, Lebanon. VISCOGLIOSI, E. Situation de la cryptosporidiose et de la blastocystose au Liban.

2018. SQUAD2 Sécurité et Qualité Agroalimentaire, Tripoli, Lebanon. BAYDOUN, M. Three-dimensional (3D) culture of adult murine colon as an in vitro model of cryptosporidiosis: proof of concept.

2019. 7th International Giardia and Cryptosporidium Conference, Rouen, France. GANTOIS, N., FOLLET, J., HAMMOUMA-GHELBOUN, O., GUYOT, K., BENAMROUZ-VANNESTE, S., FREALLE, E., SEESAO, Y., DELAIRE, B., EVEN, G., VERREZ-BAGNIS, V., RYAN, U., GAY, M., ALIOUAT-DENIS, C.-M., VISCOGLIOSI, E., CERTAD, G. Prevalence, molecular identification and risk factors for Cryptospordium infection in edible marine fish: a survey across sea areas surrounding France.

2019. 7th International Giardia and Cryptosporidium Conference, Rouen, France. AUDEBERT, C., BONARDI, F., CABOCHE, S., GUYOT, K., TOUZET, H., MERLIN, S., GANTOIS, N., CREUSY, C., MELONI, D., MOURAY, A., VISCOGLIOSI, E., CERTAD, G., BENAMROUZ-VANNESTE, S., CHABE, M. Genetic basis for virulence differences of various Cryptosporidium parvum carcinogenic isolates.

2019. 7th International Giardia and Cryptosporidium Conference, Rouen, France. SAWANT, M.,BAYDOUN, M., CREUSY, C., GANTOIS, N., CHABE, M., MOURAY, A., VISCOGLIOSI, E., CERTAD, G., BENAMROUZ-VANNESTE, S. Is Cryptosporidium parvum able to induce intestinal neoplasia in vitro?

2019. 97 Fachgespräch über Geflügelkranheiten, Hannover, Germany. LANDMAN, W.J.M., GANTOIS, N., VAN ECK, J.H.H., VAN DER HEIJDEN, H.M.J.F., VISCOGLIOSI, E. Tetratrichomonas gallinarum granuloma disease in a flock of free range layers.

2021. 3rd International Blastocystis Conference, Virtual Edition. KHALED, S., GANTOIS, N., AYOUBI, A., EVEN, G., SAWANT, M., EL HOUMAYRAA, J., NABOT, M., BENAMROUZ-VANNESTE, S., CHABE, M., CERTAD, G., EL SAFADI, D., DABBOUSSI, F., HAMZE, M., VISCOGLIOSI, E. Blastocystis sp. prevalence and subtypes distribution amongst Syrian refugee communities living in North Lebanon.

2021. 15th International Workshops on Opportunistic Protists (IWOP), Virtual Edition. SAWANT, M., BENAMROUZ, S., MELONI, D., GUYOT, K., GANTOIS, N., CHABE, M., CREUSY, C., DUVAL, E., WEITZMAN, J., VISCOGLIOSI, E., CERTAD, G.First study to characterize the role of epigenetics in the biology of the Apicomplexan parasite Cryptosporidium parvum.

2021. 13th European Multicolloquium of Parasitology, Belgrade, Serbia. LANDMAN, W.J.M., SAWANT, M., GANTOIS, N., MAJOOR, A., VAN ECK, J.H.H., VISCOGLIOSI, E. Molecular epidemiology of trichomonads in wild wetland birds in the Netherlands.

2021. 13th European Multicolloquium of Parasitology, Belgrade, Serbia. KHALED, S., SAWANT, M., GANTOIS, N., AYOUBI, A., EVEN, G., EL HOUMAYRAA, J., NABOT, M., BENAMROUZ-VANNESTE, S., CHABE, M., CERTAD, G., EL SAFADI, D., DABBOUSSI, F., HAMZE, M., VISCOGLIOSI, E. Prevalence and subtype distribution of Blastocystis amongst Syrian refugee communities living in North Lebanon

2021. 13th European Multicolloquium of Parasitology, Belgrade, Serbia. EVEN, G., LOKMER, A., RODRIGUES, J., AUDEBERT, C., VISCOGLIOSI, E., SEGUREL, L., CHABE, M. Changes in the human gut microbiota associated with colonization by Blastocystis sp. and Entamoeba spp. in non-industrialized populations

2021. 13th European Multicolloquium of Parasitology, Belgrade, Serbia. SAWANT, M., BENAMROUZ, S., MELONI, D., GUYOT, K., GANTOIS, N., CHABE, M., CREUSY, C., DUVAL, E., WINTJENS, R., VISCOGLIOSI, E., CERTAD, G. First characterization of the role of epigenetics in the dynamics of Cryptosporidium parvum infection.

2021. 13th European Multicolloquium of Parasitology, Belgrade, Serbia. SAWANT, M., BENAMROUZ, S., MOURAY, A., BOUQUET, P., GANTOIS, N., CHABE, M., CREUSY, C., DUVAL, E., MIHALACHE, A., GOSSET, P., HOT, D., VISCOGLIOSI, E., CERTAD, G. Cryptosporidium parvum infection and colon cancer ; results of a microarray approach.

2021. CRWAD – The Conference of Research Workers in Animal Diseases, Chicago, USA. MARWAN, O., BENAMROUZ, S., EL SAFADI, D., GUILAVOGUI, T., DABBOUSSI, F., HAMZE, M., VISCOGLIOSI, E., CERTAD, G. Initial data on the molecular epidemiology of cryptosporidiosis in humans and cattle in Akkar, Northern Lebanon.

2021. Congrès conjoint de la SoAP, SAV, SFMTSI, SCP et CaSE, Yaoundé Cameroon.GUILAVOGUI, T., GANTOIS, N., EVEN, G., DESRAMAUT, J., DAUTEL, E., DENOYELLE, C., CISSE, F.I., TOURE, S.C., KOUROUMA, B.L., SAWANT, M., CHABE, M., CERTAD, G., VISCOGLIOSI, E. Détection et identification moléculaire du protozoaire intestinal Blastocystis dans le cadre d'une étude à grande échelle menée dans la région de Conakry en Guinée.

2022. Annual Conference of the Microbiology Society (UK), Belfast, Ireland. EVEN, G., GANTOIS, N., GUILAVOGUI, T., CERTAD, G., MERLIN, S., MARTEL, S., VISCOGLIOSI, E., AUDEBERT, C., CHABE, M. Gut eukaryome: the special role of intestinal protozoa like Blastocystis in the gut microbiota.

2022. Experts meeting on avian diseases. Specialist group "Poultry diseases" of the German Society of Veterinary Medicine and German group of the WVPA (World Veterinary Poultry Association), Hanover, Germany. LANDMAN, W.J.M., GANTOIS, N., SAWANT, M., MAJOOR, F.A., VAN ECK, J.H.H., VISCOGLIOSI, E. Prevalence of trichomonads in the cloaca of wild wetland birds in the Netherlands

2024. 4th International Blastocystis Conference, Microbiology Society, Heraklion, Crete, Greece. CHABE, M., GANTOIS, N., MERLIN, S., EVEN, G., VISCOGLIOSI, E., AUDEBERT, C. Blastocystis in cattle: a providential « game changer » to limit global warming

2024. 4th International Blastocystis Conference, Microbiology Society, Heraklion, Crete, Greece.

DENOYELLE, C., GANTOIS, N., GARCIA DOMINGUEZ, R., WINTJENS, R., BILLON, G., ALAIMO, V., DESRAMAUT, J., CERTAD, G., DEVOS, D.P., CHABE, M., VISCOGLIOSI, E. Molecular, structural and functional characterization of the superoxide dismutases of the enteric protozoa Blastoc

 

COLLABORATIONS

 

Dans le cadre de ses activités de recherche, ECOPHIP a établi un réseau très dense de collaborations au niveau local et régional (plateformes et équipes du CIIL, Hôpital et Université de Lille, PEGASE, BiLille, Genes Diffusion, Genoscreen), national (VetAgro Sup, ANSES, IFREMER, CEA, Hôpitaux, MNHN Paris, CNRS et Inserm) et international en Europe (Belgique, Pays-Bas, Italie, Espagne, Portugal, Royaume-Uni), en Afrique (Egypte, Sénégal, Guinée, Nigéria, Madagascar), en Asie (Cambodge, Vietnam, Taiwan) et au Moyen-Orient (Liban).

 

FINANCEMENTS

* Inserm. Plan Cancer ITMO Cancer Inserm (n°EPIG201510 ) AAP Epigénétique et Cancer PARA-CAN 2016-2019 Partenaire
* SF3i Lille. Projet collaboratif CIIL et LIRIC (UMR995) 2017-2018 Coordinateur
* Plate-forme BiLille. Missions Ingénieurs 2018 Coordinateur
* CHU de Lille. Bonus H 2019 Coordinateur
* Université Catholique de Lille. GHICL Crypto-K 2019-2021 Coordinateur
* CIIL. Projets collaboratifs intra-CIIL 2020-2021 Coordinateur
* Région Hauts-de-France. Programme STIMulE - Volet "Recherche Exploratoire" AGRIMARK 2020-2022 Coordinateur
* Plate-forme BiLille. Missions Ingénieurs 2021 Coordinateur
* Société d’Accélération de Transfert Technologique (SATT) Nord 2021-2023 Coordinateur
* Ambassade de France au Vietnam. Coopération scientifique 2022 Coordinateur
* Ambassade de France Egypte. Coopération scientifique 2023 Coordinateur
* Ambassade de France au Vietnam. Coopération scientifique 2023-2024 Coordinateur
* ANSES CASABLAST 2023-2025 Partenaire
* MAE et MESR. Partenariat Hubert Curien (PHC) Programme IMHOTEP France - Egypte 2023-2025 Coordinateur
* Région Hauts-de-France / Université Catholique de Lille Bourse de thèse Martha Baydoun 2015-2018
* AZM et SAADE, Liban Bourse de thèse Stéphanie Greige 2015-2018
* AZM et SAADE, Liban Bourse de thèse Salma Khaled 2018-2021
* Programme de coopération Egypte-France (STDF-IFE) Financement Post-doc Yara Al Kappany 12 mois 2019
* Université de Lille Bourse de thèse Manasi Sawant 2019-2022
* Programme de coopération Egypte-France (STDF-IFE) Financement Post-doc Yara Doaa Naguib 14 mois 2021-2022
* Université de Lille Bourse de thèse Constance Denoyelle 2023-2026
* Région Hauts-de-France / PMCO    Bourse de thèse Manon Ryckman 2023-2026
* Université de Lille Bourse de thèse Dima Abdallah 2024-2027