Ornithorynque de la microbiology



Chef d'équipe

Damien DEVOS

Contact

Après avoir obtenu son diplôme en microbiologie moléculaire à l'université de Namur, BE, Damien P. Devos a réalisé son doctorat en bioiformatique au Centre National de Biotechnologie (CNB), à Madrid, SP. Il a ensuite passé sa période post-doctorale à l'université Rockefeller, NY et à l'UCSF, SF aux Etats-Unis en biologie structurale. Pendant cette période, il a participé au développement d'une nouvelle méthode en biologie structurale intégrative et l'a appliquée au complexe du pore nucléaire. Il a ensuite occupé un poste indépendant à l'EMBL, à Heidelberg, en Allemagne, et à l'université de Heidelberg, en Allemagne. Il a rejoint le Centre andalou de biologie du développement pour poursuivre ses travaux sur les bactéries PVC et l'évolution. Il rejoint l'Institut Pasteur de Lille en tant que lauréat du StaRS, de la Région Hauts-de-France, en 2023. L'équipe dirigée par Damien P. Devos étudie la biologie cellulaire divergente des bactéries PVC et leur position dans l'arbre de vie à partir d'approches expérimentales, computationnelles et théoriques.

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La révolution des techniques de séquençage sans culture a révélé l'immense biodiversité des organismes présents en dehors de nos laboratoires. Moins de 1 % des bactéries connues peuvent être cultivées en laboratoire. Cette diversité inclut des organismes aux caractéristiques inattendues, comme des bactéries avec un système membranaire développé, ou des bactéries qui se divisent de manière asymétrique sans la protéine FtsZ, essentielle et universellement conservée. Nous travaillons sur des bactéries du superphylum Planctomycetes, Verrucomicrobia et Chlamydiae. Ces bactéries sont des organismes non modèles représentatifs de la biodiversité et contenant une biologie divergente que nous devons caractériser. Certaines des caractéristiques trouvées chez ces bactéries ne sont pas communes aux bactéries et sont plus souvent associées aux archées ou aux eucaryotes. Pour cette raison, ces bactéries ont été appelées l'ornithorynque de la microbiologie et pourraient redéfinir notre vision actuelle de l'arbre de la vie, de la relation entre tous les organismes et du développement de la pathogénicité.
Nous étudions ces bactéries en utilisant une approche multi-espèces, multi-techniques, expérimentale, informatique et théorique.

En particulier, l'équipe étudie les bactéries PVC :
1. Modes de division
2. Systèmes endomembranaires
3. L'arbre de vie

The squalene route to C30 carotenoid biosynthesis and the origins of carotenoid biosynthetic pathways.

Santana-Molina C, Henriques V, Hornero-Méndez D, Devos DP, Rivas-Marin E. Proc Natl Acad Sci U S A. 2022 Dec 27;119(52):e2210081119. doi: 10.1073/pnas.2210081119. Epub 2022 Dec 19. PMID: 36534808

Reconciling Asgardarchaeota Phylogenetic Proximity to Eukaryotes and Planctomycetes Cellular Features in the Evolution of Life.

Devos DP. Mol Biol Evol. 2021 Aug 23;38(9):3531-3542. doi: 10.1093/molbev/msab186. PMID: 34229349

Origin and Evolution of Polycyclic Triterpene Synthesis.

Santana-Molina C, Rivas-Marin E, Rojas AM, Devos DP. Mol Biol Evol. 2020 Jul 1;37(7):1925-1941. doi: 10.1093/molbev/msaa054. PMID: 32125435

Non-essentiality of canonical cell division genes in the planctomycete Planctopirus limnophila.

Rivas-Marin E, Peeters SH, Claret Fernández L, Jogler C, van Niftrik L, Wiegand S, Devos DP. Sci Rep. 2020 Jan 9;10(1):66. doi: 10.1038/s41598-019-56978-8. PMID: 31919386

Essentiality of sterol synthesis genes in the planctomycete bacterium Gemmata obscuriglobus.

Rivas-Marin E, Stettner S, Gottshall EY, Santana-Molina C, Helling M, Basile F, Ward NL, Devos DP. Nat Commun. 2019 Jul 2;10(1):2916. doi: 10.1038/s41467-019-10983-7. PMID: 31266954